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Part I: 碳原子 Carbon
- I.1: 碳-碳鍵 Carbon-Carbon Bonds
- I.1.1 烷烴 Alkanes
- 伯碳原子 Primary carbon
- 仲碳原子 Secondary carbon
- 叔碳原子 Tertiary carbon
- 季碳原子 Quaternary carbon
- I.1.2 碳-碳雙鍵和三鍵 C-C double and Triple Bonds
- 烯烴 Alkene
- 炔烴 Alkyne
- 累積二烯烴 Allene
- I.2: 含一個碳-雜鍵 One Carbon-Hetero Bond
- I.2.1 鹵代烴 Alkyl Halogenides
- 氯代 Alkylchloride
- 氟代 Alkylfluoride
- 溴代 Alkylbromide
- 碘代 Alkyliodide
- I.2.2 醇和醚 Alcohols and Ethers
- 醇 Alcohol
- 伯醇 Primary alcohol
- 仲醇 Secondary alcohol
- 叔醇 Tertiary alcohol
- 二烷基醚 Dialkylether
- 二烷基硫醚 Dialkylthioether
- 烷基芳基醚 Alkylarylether
- 二芳基醚 Diarylether
- 烷基芳基硫醚 Alkylarylthioether
- 二芳基硫醚 Diarylthioether
- 氧鎓鹽 Oxonium
- I.2.3 胺類 Amines
- 胺 Amine
- 脂肪伯胺 Primary aliphatic amine
- 脂肪仲胺 Secondary aliphatic amine
- 脂肪叔胺 Tertiary aliphatic amine
- 脂肪季銨鹽 Quaternary aliphatic ammonium
- 芳香伯胺 Primary aromatic amine
- 芳香仲胺 Secondary aromatic amine
- 芳香叔胺 Tertiary aromatic amine
- 芳香季銨鹽 Quaternary aromatic ammonium
- 混合仲胺 Secondary mixed amine
- 混合叔胺 Tertiary mixed amine
- 混合季銨鹽 Quaternary mixed ammonium
- 銨鹽 Ammonium
- I.2.4 其他含一個碳雜鍵 Others
- 巰基 Alkylthiol
- 二烷基硫醚 Dialkylthioether
- 烷基芳基硫醚 Alkylarylthioether
- 二硫化物 Disulfide
- 1,2-氨基醇 1,2-Aminoalcohol
- 1,2-鄰二醇 1,2-Diol
- 1,2-偕二醇 1,1-Diol
- 氫過氧化物 Hydroperoxide
- 過氧化物 Peroxo
- 有機鋰化合物 Organolithium compounds
- 有機鎂化合物 Organomagnesium compounds
- 金屬有機化合物 Organometallic compounds
- I.3: 含兩個碳-雜鍵（羰基及衍生物） Two Carbon-Hetero Bonds (Carbonyl and Derivatives)
- I.3.1 碳-雜雙鍵 Double Bond to Hetero
- 醛 Aldehyde
- 酮 Ketone
- 硫醛 Thioaldehyde
- 硫酮 Thioketone
- 亞胺 Imine
- 亞胺鹽 Immonium
- 肟 Oxime
- 肟醚 Oximether
- I.3.2. 兩個碳-雜單鍵 Two Single Bonds to Hetero
- 縮醛 Acetal
- 半縮醛 Hemiacetal
- 縮醛胺 Aminal
- 半縮醛胺 Hemiaminal
- 硫縮醛 Thioacetal
- 硫半縮醛 Thiohemiacetal
- 鹵代縮醛 Halogen acetal like
- 其他類縮醛 Acetal like
- 鹵代甲基醚 Halogenmethylen ester and similar
- 氮、氧、硫代甲基醚 NOS methylen ester and similar
- 其他雜代甲基醚 Hetero methylen ester and similar
- 羥腈 Cyanhydrine
- I.3.3 兩個碳-雜鍵接碳-碳雙鍵（類似烯醇） Single Bond to Hetero, C=C Double Bond (Enols and Similar)
- 氯代烯烴 Chloroalkene
- 氟代烯烴 Fluoroalkene
- 溴代烯烴 Bromoalkene
- 碘代烯烴 Iodoalkene
- 烯醇 Enol
- 烯二醇 Endiol
- 烯醇醚 Enolether
- 烯醇脂 Enolester
- 烯胺 Enamine
- 烯硫醇 Thioenol
- 烯硫醚 Thioenolether
- I.4: 含三個碳-雜鍵（羧基衍生物） Three Carbon-Hetero Bonds (Carboxyl and Derivatives)
- 酰氯 Acylchloride
- 酰氟 Acylfluoride
- 酰溴 Acylbromide
- 酰碘 Acyliodide
- 酰鹵 Acylhalide
- 羧酸 Carboxylic acid
- 羧酸酯 Carboxylic ester
- 內酯 Lactone
- 酸酐 Carboxylic anhydride
- 羧酸衍生物 Carboxylic acid derivative
- 硫代羧酸 Carbothioic acid
- 硫代羧酸(硫)酯 Carbothioic S ester
- 硫代羧酸(硫)內酯 Carbothioic S lactone
- 硫代羧酸(氧)酯 Carbothioic O ester
- 硫代羧酸(氧)內酯 Carbothioic O lactone
- 硫代羧酸酰鹵 Carbothioic halide
- 二硫代羧酸 Carbodithioic acid
- 二硫代羧酸酯 Carbodithioic ester
- 二硫代羧酸內酯 Carbodithiolactone
- 酰胺 Amide
- 伯酰胺 Primary amide
- 仲酰胺 Secondary amide
- 叔酰胺 Tertiary amide
- 內酰胺 Lactam
- 烷基酰亞胺 Alkyl imide
- 氮雜酰亞胺 N hetero imide
- 酰亞胺(酸性) Imide acidic
- 硫代酰胺 Thioamide
- 硫代內酰胺 Thiolactam
- 肟酯 Oximester
- 脒(不屬于芳香環一部分) Amidine
- 羥肟酸 Hydroxamic acid
- 羥肟酸酯 Hydroxamic acid ester
- 亞氨酸 Imidoacid
- 環亞氨酸 Imidoacid cyclic
- 亞氨酸酯 Imidoester
- 亞氨酸內酯 Imidolactone
- 硫代亞氨酸 Imidothioacid
- 硫代環亞氨酸 Imidothioacid cyclic
- 硫代亞氨酸酯 Imidothioester
- 硫代亞氨酸內酯 Imidothiolactone
- 脒(非(硫代)羰基取代且不屬于環結構) Amidine
- 亞氨酸內酰胺 Imidolactam
- 亞氨酸酰鹵 Imidoylhalide
- 環亞氨酸酰鹵 Imidoylhalide cyclic
- 氨基腙 Amidrazone
- Alpha-氨基酸 Alpha aminoacid
- Alpha-羥基酸 Alpha hydroxyacid
- 肽鍵 Peptide middle
- 多肽碳端 Peptide C term
- 多肽氮端 Peptide N term
- 原羧酸酯 Carboxylic orthoester
- 烯酮 Ketene
- 烯醛 Ketenacetal
- 腈 Nitrile
- 異腈 Isonitrile
- 共軛羰基及衍生物 Vinylogous carbonyl or carboxyl derivative
- 共軛羧酸 Vinylogous acid
- 共軛羧酸酯 Vinylogous ester
- 共軛酰胺 Vinylogous amide
- 共軛酰鹵 Vinylogous halide
- I.5: 含四個碳-雜鍵（碳酸衍生物） Four Carbon-Hetero Bonds (Carbonic Acid and Derivatives)
- 碳酸二酯 Carbonic acid dieester
- 碳酸脂酰鹵 Carbonic acid esterhalide
- 碳酸單酯 Carbonic acid monoester
- 碳酸衍生物 Carbonic acid derivatives
- 硫代碳酸二酯 Thiocarbonic acid dieester
- 硫代碳酸脂酰鹵 Thiocarbonic acid esterhalide
- 硫代碳酸單脂 Thiocarbonic acid monoester
- 脲 Urea
- 硫脲 Thiourea
- 異脲 Isourea
- 異硫脲 Isothiourea
- 胍 Guanidine
- 氨基甲酸 Carbaminic acid
- 氨基甲酸酯 Urethan(Carbamate ester)
- 縮二脲 Biuret
- 氨基脲 Semicarbazide
- 碳酰肼 Carbazide
- 縮氨基脲 Semicarbazone
- 縮（對稱）二氨基脲 Carbazone
- 氨基硫脲 Thiosemicarbazide
- 硫代卡巴肼 Thiocarbazide
- 縮氨基硫脲 Thiosemicarbazone
- 硫卡巴腙 Thiocarbazone
- 異氰酸酯 Isocyanate
- 氰酸酯 Cyanate
- 異硫氰酸酯 Isothiocyanate
- 硫氰酸酯 Thiocyanate
- 碳二亞胺 Carbodiimide
- 原碳酸衍生物 Orthocarbonic derivatives
- I.6 芳香族 Aromatics
- 酚 Phenol
- 鄰二酚 1,2-Diphenol
- 芳基氯 Arylchloride
- 芳基氟 Arylfluoride
- 芳基溴 Arylbromide
- 芳基碘 Aryliodide
- 硫酚 Arylthiol
- 氮雜芳香環 Iminoarene
- 氧雜芳香環 Oxoarene
- 硫雜芳香環 Thioarene
- 芳環上有含氫堿性氮原子 Hetero N basic H
- 芳環上有不含氫堿性氮原子 Hetero N basic no H
- 芳環上有非堿性氮原子 Hetero N nonbasic
- 芳環上有氧原子 Hetero O
- 芳環上有硫原子 Hetero S
- 含雜原子芳香化合物 Heteroaromatic
Part II: 氮，硫，磷，硅，硼原子 N, S, P, Si, B
- II.1 氮 Nitrogen
- 亞硝酸鹽 Nitrite
- 硫代亞硝酸鹽 Thionitrite
- 硝酸鹽 Nitrate
- 硝基 Nitro
- 亞硝基 Nitroso
- 疊氮化合物 Azide
- 酰疊氮 Acylazide
- 重氮基 Diazo
- 重氮鹽 Diazonium
- 亞硝胺 Nitrosamine
- 亞硝酰胺 Nitrosamide
- 氧化胺 N-Oxide
- 肼 Hydrazine
- 腙 Hydrazone
- 羥胺 Hydroxylamine
- II.2 硫 Sulfur
- 砜 Sulfon
- 亞砜 Sulfoxide
- 锍鹽 Sulfonium
- 硫酸 Sulfuric acid
- 硫酸單酯 Sulfuric monoester
- 硫酸二酯 Sulfuric diester
- 硫酸單酰胺 Sulfuric monoamide
- 硫酸雙酰胺 Sulfuric diamide
- 硫酸單酰胺酯 Sulfuric esteramide
- 硫酸衍生物 Sulfuric derivative
- 磺酸 Sulfonic acid
- 磺酰胺 Sulfonamide
- 磺酸酯 Sulfonic ester
- 磺酰鹵 Sulfonic halide
- 磺酸衍生物 Sulfonic derivative
- 亞磺酸 Sulfinic acid
- 亞磺酰胺 Sulfinic amide
- 亞磺酸酯 Sulfinic ester
- 亞磺酰鹵 Sulfinic halide
- 亞磺酸衍生物 Sulfinic derivative
- 次磺酸 Sulfenic acid
- 次磺酰胺 Sulfenic amide
- 次磺酸酯 Sulfenic ester
- 次磺酰鹵 Sulfenic halide
- 次磺酸衍生物 Sulfenic derivative
- II.3 磷 Phosphorous
- 膦 Phosphine
- 氧化膦 Phosphine oxide
- 鏻鹽 Phosphonium
- 磷酰基 Phosphorylen
- 膦酸 Phosphonic acid
- 膦酸單酯 Phosphonic monoester
- 膦酸雙酯 Phosphonic diester
- 膦酸單酰胺 Phosphonic monoamide
- 膦酸雙酰胺 Phosphonic diamide
- 膦酸單酰胺酯 Phosphonic esteramide
- 膦酸衍生物 Phosphonic acid derivative
- 磷酸 Phosphoric acid
- 磷酸單酯 Phosphoric monoester
- 磷酸雙酯 Phosphoric diester
- 磷酸三酯 Phosphoric triester
- 磷酸單酰胺 Phosphoric monoamide
- 磷酸雙酰胺 Phosphoric diamide
- 磷酸三酰胺 Phosphoric triamide
- 膦酸單酯單酰胺 Phosphoric monoestermonoamide
- 膦酸雙酯單酰胺 Phosphoric diestermonoamide
- 膦酸單酯雙酰胺 Phosphoric monoesterdiamide
- 磷酸衍生物 Phosphoric acid derivative
- 次膦酸 Phosphinic acid
- 次膦酸酯 Phosphinic ester
- 次膦酸酰胺 Phosphinic amide
- 次膦酸 Phosphinic acid derivative
- 亞膦酸 Phosphonous acid
- 亞膦酸單酯 Phosphonous monoester
- 亞膦酸雙酯 Phosphonous diester
- 亞膦酸單酰胺 Phosphonous monoamide
- 亞膦酸雙酰胺 Phosphonous diamide
- 亞膦酸單酰胺酯 Phosphonous esteramide
- 亞膦酸衍生物 Phosphonous derivatives
- 三價膦酸 Phosphinous acid
- 三價膦酸酯 Phosphinous ester
- 三價膦酸酰胺 Phosphinous amide
- 三價膦酸衍生物 Phosphinous derivatives
- II.4 硅 Silicon
- 四取代硅烷（全取代） Quart silane
- 非四級硅烷（含氫原子） Non-quart silane
- 單鹵代硅烷 Silylmonohalide
- 單雜三烷基硅烷 Het trialkylsilane
- 二雜二烷基硅烷 Dihet dialkylsilane
- 三雜單烷基硅烷 Trihet alkylsilane
- 硅酸衍生物 Silicic acid derivative
- II.5 硼 Boron
- 三烷基硼烷 Trialkylborane
- 硼酸衍生物 Boric acid derivatives
- 一烴基硼酸衍生物 Boronic acid derivative
- 硼氫化物 Borohydride
- 四取代硼原子 Quaternary boron
Part III: 特殊結構特征 Some Special Patterns
- III.1 鏈狀結構 Chains
- III.2 環狀結構 Rings
- 芳香環 Aromatic
- 雜環 Heterocyclic
- 環氧化合物 Epoxide
- 氮雜環丙烷 NH aziridine
- 螺環 Spiro
- 并環 Annelated rings
- 橋環 Bridged rings
- III.3 糖、核苷/核苷酸，甾族化合物 Sugars and Nucleosides/Nucleotides, Steroids
- 糖，含至少一個氧原子以及一個（五員環）或兩個（六員環）氧取代基 Sugar pattern 1
- 糖，含至少一個氧原子以及2位上的縮醛鍵 Sugar pattern 2
- 糖，以上兩種的并集 Sugar pattern combi
- 還原性糖（半縮醛） Sugar pattern 2 reducing
- 還原性糖（alpha構型） Sugar pattern 2 alpha
- 還原性糖（beta構型） Sugar pattern 2 beta
- III.4 其他結構特征 Everything else...
- 共軛雙鍵 Conjugated double bond
- 共軛三鍵 Conjugated tripple bond
- 順式雙鍵 Cis double bond
- 反式雙鍵 Trans double bond
- 混合酸酐 Mixed anhydrides
- 鹵代雜原子 Halogen on hetero
- 鹵素多取代 Halogen multi subst
- 三氟甲基 Trifluoromethyl
- 碳-氧、氮、硫鍵 C ONS bond
- 帶電荷 Charged
- 陰離子 Anion
- 陽離子 Kation
- 鹽 Salt
- 1,3互變異構 1,3-Tautomerizable
- 1,5互變異構 1,5-Tautomerizable
- 帶自由旋轉化學鍵 Rotatable bond
- Michael加成受體 Michael acceptor
- 偶氮二羧酸衍生物 Dicarbodiazene
- 酸性C-H CH-acidic
- 強酸性C-H CH-acidic strong
- 有手性中心 Chiral center specified